學院下設水利工程系、建筑工程系、環境工程系、機電工程系、信息工程系、經濟管理系、商務管理系、基礎科學部和國際合作部等9個系部，開設50個專業，涵蓋水利、土建、制造、電子信息、財經、旅游、藝術設計傳媒等12個專業大類。水利工程和建筑工程技術專業是全國水利高等職業教育示范專業。水利工程和機電一體化技術專業是國家財政專項建設經費重點支持專業。水利工程和機電一體化技術專業被山東省教育廳確定為職業教育十、百、千工程建設方案示范專業。水利工程、建筑工程技術、電子信息工程、機電一體化技術、水利水電工程管理和會計電算化等6個專業被山東省教育廳確定為山東省高等學校特色專業。水利工程、建筑工程技術、機電一體化技術、電子信息工程技術、酒店管理、道路橋梁工程技術、土木工程檢測技術、電氣自動化技術等8個專業是全國水利高等職業教育示范院校重點建設專業。
